82回（2006年）大会：
3区
| 区間順位 | 大学 | 選手 | 区間タイム | 総合順位 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 東海大学 | 1年 佐藤 悠基 | 1時間2分12秒 | 6 |
| 2 | 日本大学 | 3年 福井 誠 | 1時間3分43秒 | 3 |
| 3 | 中央大学 | 2年 上野 祐一郎 | 1時間3分48秒 | 8 |
| 3 | 中央大学 | 2年 上野 裕一郎 | 1時間3分48秒 | 8 |
| 4 | 東洋大学 | 3年 尾田 寛幸 | 1時間4分10秒 | 10 |
| 5 | 山梨学院大学 | 4年 片貝 勝浩 | 1時間4分18秒 | 2 |
| 6 | 亜細亜大学 | 3年 岡田 晃 | 1時間4分26秒 | 1 |
| 7 | 駒澤大学 | 4年 井手 貴教 | 1時間4分43秒 | 5 |
| 8 | 順天堂大学 | 3年 松瀬 元太 | 1時間4分48秒 | 4 |
| 9 | 城西大学 | 2年 山口 浩一 | 1時間4分55秒 | 11 |
| 10 | 明治大学 | 4年 幸田 高明 | 1時間5分19秒 | 18 |
| 11 | 大東文化大学 | 3年 加藤 徳一 | 1時間5分20秒 | 12 |
| 12 | 法政大学 | 2年 下川原 温 | 1時間5分35秒 | 7 |
| 13 | 早稲田大学 | 3年 宮城 普邦 | 1時間5分43秒 | 13 |
| 14 | 神奈川大学 | 2年 森津 翔太 | 1時間6分25秒 | 16 |
| 15 | 専修大学 | 3年 湯野 隆太朗 | 1時間6分33秒 | 15 |
| 16 | 國學院大學 | 3年 竹下 大亮 | 1時間6分36秒 | 14 |
| 17 | 日本体育大学 | 3年 永田 淳 | 1時間6分40秒 | 9 |
| 18 | 国士舘大学 | 1年 川崎 健太 | 1時間6分49秒 | 19 |
| 19 | 関東学連選抜 | 2年 藤原 忠昌 | 1時間7分18秒 | 参考 |
| 20 | 中央学院大学 | 2年 木村 聡寿 | 1時間9分5秒 | 17 |
